Investigadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) lideran un proyecto de investigación realizado en colaboración con 40 hospitales de toda España para analizar los genomas comparados del nuevo coronavirus de pacientes con enfermedad Covid-19. El objetivo es “entender y predecir la evolución y epidemiología del virus”, según han informado desde el CSIC.

La información generada será depositada en repositorios públicos, así como en la plataforma global NextStrain (nextstrain.org), con el objetivo de servir de base de datos para las autoridades y gestores sanitarios. Este proyecto forma parte de la nueva Plataforma Temática Interdisciplinar Salud Global, que ha lanzado el CSIC para abordar el coronavirus SARS-CoV-2 desde la investigación.

Iñaki Comas, responsable de este proyecto liderado por el CSIC, ha comentado que el objetivo es “incorporar la epidemiología genómica como una herramienta para entender el curso de la epidemia, cómo se originó y cómo está evolucionando en el tiempo y en el espacio”. Asimismo, se ha planteado “el reto de generar resultados que sirvan para informar a las autoridades de salud pública”.

Además de Iñaki Comas, que pertenece al Instituto de Biomedicina de Valencia (IBV-CSIC), también lideran este proyecto Fernando González Candelas, investigador del Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio) del CSIC y la Universitat de València, con la colaboración de la Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica (FISABIO) de la Generalitat Valenciana.

Con el nombre ‘Addressing unknowns of Covid-19 transmission and infection combining pathogen genomics and epidemiology to inform public health interventions’, esta investigación tiene un presupuesto de 740.000 euros. Para alcanzar sus objetivos, combina datos genómicos, con la microbiología clínica, la epidemiología y la filogénesis.

Según González Candelas, la escala geográfica del proyecto abarca hospitales de toda España: “Aunque se ha producido una afectación general por Covid-19, la realidad es que cada comunidad está en una fase epidémica diferente y, por tanto, las soluciones a medio plazo deben ser distintas”.

Repositorios públicos

Los responsables del proyecto, especialistas en epidemiología genómica, han indicado que los datos generados serán depositados en repositorios públicos y en la plataforma global NextStrain, de la que se ha derivado un nodo español (nextspain.uv.es) que ya está integrando los datos de secuencias españolas. La plataforma implementa herramientas de visualización muy potentes para poder seguir la evolución del virus en el espacio y en el tiempo.

Esta investigación ha sido financiada, entre otros, por la Plataforma Temática Interdisciplinar (PTI) Salud Global del CSIC, en la que colaboran más de 150 grupos de investigación y que cuenta con el apoyo de la Fundación Mapfre.

Según Jesús Marco, vicepresidente de Investigación Científica y Técnica del CSIC, “la PTI Salud Global tiene una visión global que permite enlazar todos los aspectos de la pandemia: origen, prevención, enfermedad, medidas de contención, tratamiento, impacto social, y finalmente, la necesidad de comunicación a la sociedad”. La plataforma está coordinada por la investigadora del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBMSO) Margarita del Val, apoyada por un comité de expertos de diferentes disciplinas.